1992年,一架飛碟突然出現(xiàn)日本上空。飛碟走下三名自稱時(shí)來(lái)自23世紀(jì)地球聯(lián)邦機(jī)構(gòu)的官員,他們要求直接與日本首腦對(duì)話,敦促日本盡快消滅哥斯拉,防止重蹈未來(lái)亡國(guó)的命運(yùn)?! J卵芯扛鞣N神秘事件的寺澤健一郎(豐原功補(bǔ) 飾)在未來(lái)寫過(guò)《哥斯拉誕生》一書(shū),其中披露了這只恐怖怪獸誕生的秘密。根據(jù)這本書(shū)的記載,未來(lái)人提出要健一郎、曾在太平洋戰(zhàn)爭(zhēng)期間目擊哥斯拉的恐龍專家真崎洋典(佐佐木勝?gòu)?飾)以及國(guó)家超科學(xué)研究中心成員三枝未希(小高惠美 飾)乘坐時(shí)光機(jī)返回1944年的拉哥斯小島,試圖將哥斯拉傳送到別的地方。 寺澤他們的行動(dòng)取得成功,但是20世紀(jì)卻出現(xiàn)了另一頭怪獸三頭金龍王。種種詭異事件的背后,可怕的危機(jī)遽然降臨………