在1999年,一艘外星宇宙戰(zhàn)艦墜落到了地球,人們用了了十年的時間修復并取名為"MACROSS"。2009年,MACROSS要塞正在舉辦一場偶像歌星林明美(飯島真理 配音)的演唱會,突然空襲警報響起,要塞開始了變形。戰(zhàn)斗中,一條輝(長谷有洋 配音)駕駛著變形戰(zhàn)斗救下一名少女,戰(zhàn)機卻由于速度過快撞進外層艙室。安定后,輝發(fā)現(xiàn)救得是林明美。倆人相識后,為使明美高興,輝偷開教練機帶著明美去兜風。敵人趁機出現(xiàn),好在朋友這時挺身相救,經(jīng)過一場混戰(zhàn),輝和早瀨未沙(土井美加 配音)醒過來,發(fā)現(xiàn)在一個荒蕪的星球上。他們了解到,五十萬年前,一個叫"普羅多"的古代文明發(fā)展到頂盛時,已經(jīng)可以借遺傳密碼無性繁殖后代,于是國家分裂為由男性組成的"杰特拉帝"和由女性組成的"赫而特蘭帝"開始了長達數(shù)萬年的戰(zhàn)爭。在戰(zhàn)爭中文明急劇衰退了,曾經(jīng)偉大的文化被遺忘殆盡,退化成了只會戰(zhàn)斗的種族,為了維護和平,他們將會采取怎樣的行動…… 《超時空要塞》是1982至83年間播出的一部電視動畫,本片在其基礎上精簡改編而成。